黑龙江生态工程职业学院与牡丹江林业职业技术学院，这两所高等职业院校各自在特定领域内积累了丰富的教学与科研经验。然而，根据当前的实际情况来看，两校合并似乎并不具备理想条件。

首先，从专业设置来看，两所学校虽然都涉及林业和生态工程相关领域，但具体的专业方向存在较大差异。黑龙江生态工程职业学院可能更侧重于生态环境保护、资源管理等方向，而牡丹江林业职业技术学院则可能更加专注于森林培育、木材加工等方面。这种专业差异使得两校在合并后很难形成互补优势。

其次，在师资力量方面，两所学校各自拥有了一批具有丰富经验和专业背景的教师队伍。如果强行合并，如何合理分配和整合这些师资力量成为一大挑战。此外，不同学校的教学理念、管理方式也可能存在差异，这需要时间来磨合。

最后，在设施设备方面，两所学校可能已经投入大量资源建设了适合各自发展的基础设施。如果合并后需要重新规划和调整这些设施设备的布局和使用方式，无疑会增加额外的成本和管理难度。

综上所述，在当前情况下，黑龙江生态工程职业学院与牡丹江林业职业技术学院进行合并并不是最优选择。双方应继续保持各自的特色和发展方向，在适当的时候寻找更为合适的合作模式。