中医基础医学的理论基础是阴阳五行学说。这一理论体系是中国古代哲学思想的重要组成部分，它认为宇宙间的一切事物和现象都可以用阴阳两种对立而又统一的力量来解释。在中医中，阴阳不仅指自然界中的日月、寒热等自然现象，还涵盖了人体内部的生理功能和病理变化。阴阳平衡是健康的基础，任何一方的偏盛或偏衰都会导致疾病的发生。

五行学说则是对自然界五种基本物质——木、火、土、金、水及其相互关系的一种哲学概括。五行之间存在着相生（促进）和相克（制约）的关系，这种关系被应用到人体的脏腑功能和经络系统中，用来解释人体内外环境的变化以及疾病的产生和发展。

在中医基础医学中，阴阳五行学说为辨证论治提供了理论依据。通过观察患者的整体状况，包括面色、舌象、脉象等体征，医生可以判断出患者的体质偏向以及疾病发生的内在原因。基于这些信息，医生会采用相应的治疗方法来调整患者的阴阳平衡和五行之间的协调关系。

此外，中医基础医学还强调“天人合一”的理念，认为人体是一个小宇宙，与外部的大宇宙（自然环境）息息相关。因此，在治疗疾病时不仅要考虑人体内部的因素，还要结合季节变化、地理环境等因素进行综合分析。

总之，阴阳五行学说是中医基础医学的核心理论之一，它不仅为中医提供了独特的疾病诊断方法和治疗原则，也是连接中国古代哲学与现代医学的重要桥梁。