邮轮长崎和熊本都是日本九州岛上的著名旅游目的地，各有特色，适合不同类型的游客。选择哪个地方更好，取决于您的兴趣和旅行目的。

长崎是一个历史悠久的城市，拥有丰富的文化遗产和美丽的自然风光。作为日本最早对外开放的港口之一，长崎保留了大量具有西方风格的建筑，如长崎教堂和荷兰馆。此外，您还可以参观原子弹爆炸纪念公园，了解历史事件背后的故事。长崎周边还有许多美丽的海滩和山景，适合喜欢户外活动的游客。

熊本则以温泉、火山和美食闻名。熊本城是日本最古老的城堡之一，拥有悠久的历史。周围的阿苏火山群提供了徒步、登山等户外活动的机会。熊本的温泉众多，其中最著名的是阿苏温泉和球磨温泉。这里的美食也值得一提，特别是熊本牛肉和各种当地特色小吃。

从邮轮上访问这两个地方都非常方便。如果您乘坐邮轮到达长崎港，可以直接体验到这座城市的文化魅力；而从熊本港出发，则可以更深入地探索周边自然景观。

总的来说，选择长崎还是熊本取决于您对历史文化的兴趣程度以及是否偏好自然风光和户外活动。如果您想深入了解日本的历史背景并体验西方文化的影响，那么长崎可能是更好的选择；而如果您更喜欢大自然的宁静与美丽，并且对当地美食感兴趣的话，则不妨考虑熊本。